Bioinfor-Claw：为生物信息学打造的模块化AI智能体技能库

一个包含50个专项技能的生物信息学智能体平台，支持独立运行、OpenClaw和Claude Code集成，涵盖公共数据访问、多组学分析、CRISPR设计、基因分析、蛋白质结构、机器学习、文献检索等10大应用场景。

Bioinfor-Claw 具有独特的双重属性，这使其能够适应不同的使用场景：

作为独立生物信息学智能体：克隆仓库后运行单个命令，即可获得基于浏览器的聊天界面，由能够自主选择工具、运行分析、跨轮次记忆上下文并返回可发表级别图表和表格的自主智能体提供支持。无需外部智能体框架。

作为模块化技能库：所有50个分析能力都被打包为自包含的、智能体友好的技能（每个技能都包含 SKILL.md、可用的Python实现和明确的输入/输出契约），可以插入 OpenClaw、Claude Code 或任何扫描 SKILL.md 文件的自定义智能体。

这种双重特性是刻意设计的。你可以将 Bioinfor-Claw 作为独立的"桌面AI实验科学家"使用，也可以将其嵌入到你已经在运行的更大智能体平台中，或者直接从脚本和管道调用单个技能——相同的技能在所有三种模式下都能工作。

• 自动路由智能体循环：读取 SKILL.md 文件，从纯英文请求中选择正确的技能，填充必需参数，执行并恢复错误
• 多LLM后端支持：Anthropic、OpenAI、Google、Mistral、MiniMax，以及支持任何OpenAI兼容端点的自定义选项
• 跨轮次记忆：追踪讨论的实体（基因、癌症、UniProt ID）、近期分析和用户偏好
• 可配置的步骤预算：每个请求默认30轮工具调用，检测到模块化/多数据集工作流时自动提升至45轮以上
• 文件处理：支持拖放CSV/TSV/VCF/FASTA/JSON/BED上传，服务器路径自动接入 run_script 调用
• 结果渲染：内联图表预览、整合下载卡片、可折叠的错误追踪

特性	说明
50个专项技能	涵盖数据访问、多组学、CRISPR、基因列表、基因中心、结构、机器学习、绘图、文献、实验室追踪
标准化SKILL.md	每个技能声明用途、输入、输出、执行策略和触发短语
纯Python实现	基于numpy/pandas/matplotlib/scipy/lifelines技术栈，无R依赖
每个技能独立的requirements.txt	仅安装所需依赖
稳定的文件命名和TSV/PNG/SVG输出	设计用于下游链式调用

Bioinfor-Claw 目前涵盖10个应用场景，共50个技能：

从NCBI GEO、TCGA/GDC、GTEx和DepMap发现、查询、下载、缓存和组织公共生物数据集。

转录组学、基因组学、表观基因组学、蛋白质组学和单细胞数据分析，包括RNA-seq差异表达、ATAC-seq/ChIP-seq下游分析、DNA甲基化分析、质谱蛋白质组学和单细胞RNA-seq基础分析。

涵盖SpCas9/Cas12 sgRNA设计、碱基编辑器sgRNA设计（CBE/ABE/双编辑器，13种编辑器预设）、先导编辑器pegRNA设计、混合筛选分析（MAGeCK RRA/MLE）、筛选QC和混合文库设计。